Od svibnja 2015. godine u Sektoru za informacijski sustav, Carinske uprave provodile su se aktivnosti vezane uz projekt Projektiranje i implementacija sustava upravljanja informacijskom sigurnošću (engl. ISMS - Information security management system) prema normi ISO/IEC 27001:2013. Projektne aktivnosti obuhvatile su razvoj i uspostavu sustava informacijske sigurnosti, izradu obvezne dokumentacije u skladu sa zahtjevima norme, te sve ostale aktivnosti vezane uz pripremu za provedbu certifikacije ISMS Sektora za informacijski sustav.
Sustav informacijske sigurnosti i certifikacija prema ISO/IEC 27001:2013 obuhvatila je tri lokacije Sektora za informacijski sustav, Središnji ured, Data centar i Disaster Recovery Location, u dijelu upravljanja informacijsko komunikacijskom infrastrukturom; upravljanja razvojem, testiranjem i održavanjem aplikacija u carinskoj službi.
Projekt je završen u prosincu 2015., provedenim postupkom certifikacije u Sektoru za informacijski sustav i dobivanjem certifikata u skladu sa standardom ISO/IEC 27001:2013.